28 Haziran 1911'de kurulan Hava Kuvvetleri Komutanlığında önceleri Pilotlar ve Uçak Bakım sınıfı personel görev almış, 1923 yılında envantere giren ilk telsizli ve tamamı alüminyum gövdeli uçaklar olan Junkers’lerle birlikte, Uçak Bakım sınıfı personelden bir kısmına Telsiz Kursları verilerek Muhabere sınıfı personel ihtiyacı karşılanmıştır.

Gelişen teknoloji paralelinde, Telsiz, Seyrüsefer Radar ve İletişim sistemlerinin işletme, bakım, idame ve yönetiminin sağlayacak Muhabere sınıfı personelin yetiştirilmesi amacıyla, 28 Haziran 1949’da Gaziemir İZMİR’de, halen İkmal Komutanlığı ve Sağlık Amirliği olarak kullanımda olan binalar ile çevresindeki barakalarda Hava Muhabere Okulu kurulmuştur.Okulda; Temel Elektrik–Elektronik, Telsiz, Telli, Radar,  Elektronik Harp, S/S Yardımcı Sistemleriyle ilgili eğitimler verilerek Muhabere sınıfından Subay, Astsubay ve Erler yetiştirilmeye başlanmıştır.

Muhabere Okulu, 1972 yılında aynı garnizonda inşa edilen yeni binasına taşınmış, 1982 yılında ilave bir bina inşa edilerek bu güne kadar iki ayrı binada eğitim faaliyetlerine devam etmiştir.

Muhabere Okulunun ismi, teşkilatında yapılan değişikliklerle, 1962 yılında Muhabere Elektronik Okul Komutanlığı, 1993’te Muhabere Elektronik ve Bilgi Sistemler (MEBS) Okul Komutanlığı olarak değiştirilmiştir.

MEBS Okul Komutanlığı, yılda iki binden fazla MEBS sınıfındaki Subay, Astsubay ve Sivil Personele, Temel Eğitim ve Mesleki Gelişim Eğitimlerini veren, ayrıca diğer sınıf ve branşlardaki personelin meslek eğitimleri için gerek duyulan elektronik ve bilgisayar eğitimi ihtiyaçlarını karşılayan bir eğitim kurumudur.

MEBS Okul Komutanlığı halen ŞUBAT 2005 tarihinde tamamlanan yeni binasında hizmetine devam etmektedir.